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[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]|
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面=E-gYF 遇到有台灣深山的時候 通常都會說:RfdI6& 台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種&?@] 最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型bK[!, ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 _c7 所以難免會讓人想知道_b 它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)Cv 或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異_cf} ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 seaNv3 很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討Mu 但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論HQ^x#D 因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析~=16w ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 cX[A 我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係q(&fzq 用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉1aG)~& (用養的要花很久的時間、很多的空間,對我來說比較困難)[ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 P/h 以下是我有的個體分佈圖p} ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 E4
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按此查看圖片詳細資料I{" ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 z_TY ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ?|P+4 (圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)Q6~ 最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來SA 下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山pZ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 "1#J 中部藍色為溪頭及杉林溪u%LX!? ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 96 南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園}uwn` ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 !! 東部灰色是瑞穗林道g)"Z\n (論壇如果不能公布地點,請告訴我,我會把這一段d掉)K` ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 3X0M,F 一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置~Ol8+J 有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標5#Lf{c 如果看了不舒服 非常抱歉=`ZaC" ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 $nty%N
一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNA)dYB8% (NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)c 後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析/ CO1在粒線體的位置如下:3mPf ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 h#$)
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按此查看圖片詳細資料;Z ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 F5n7v> ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 _Hu,J, ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 4/ 我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primers:i Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014' ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 +*$]o:
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按此查看圖片詳細資料# ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 aqE ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ?MKi ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 [ PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning."QhlW 總共的長度是1302個basepairs)Cb' (因為是universal primer pair,他不是很專一,直接定序不好看。而且>3 1302個basepairs必須要再設計一組internal primersnQ3~A 才能得到完整漂亮的序列,乾脆用clone比較方便 )q^ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 1p>J+ 選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群fu (期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)Xf(DW ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 F]]y#Y 用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)^a 然後用Mega跑Parsimony analysis6g5$t ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 md2?yF 以下的圖是24個most parsimony tree的consensus tree!"$7~ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 quph,m
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按此查看圖片詳細資料^EC ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 mM ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 >x"mC> (TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山|FG NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道JET TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)jr ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 N> 從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構ma_@Y 已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)| ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 4)El5d 大概分成中北部、中南部及東部三群<8r 其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣' 然後分成東部的族群 以及中北部的族群~Za`S 中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶BfWm-| ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ObZ.#
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按此查看圖片詳細資料xx'iC ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Lb6nS ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 XB- ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 _ 以上大概就是初步的結果m"s 畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少*~`<h 所以你也可以不相信我的結果yR^x m ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 1+ers) 無論如何}| 這是一個值得繼續作下去的題目9y 至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大!P 我可以找到的相關文獻在這maltk http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdf@\~ 台灣深山似乎也有類似allometry的現象X7Hy 族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多%JAdc: 族群密度地的地方似乎比較少e}pm} 而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了<jXNE3 不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性FgT3Z ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 @i]C; 大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點HPIRXu 但是我沒辦法和我的結果連想起來
相關資料也不多(大多是長度&重量)j^cMu. ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 sNB 以後還要多收集不同產地的台灣深山E*L 以及多去博物館量外部型態特徵=;Ls (想要到交易版徵有確切產地的蟲,可是不敢 呵呵)*DT% ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 it'K 感謝很多送我標本的人jH 裡面只有溪頭一隻是我自己抓的L,24 其他的夢蟲無我老闆提供很多 G 嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等c[ 非常感謝~ 外群是跟zozo買來的乾標本8@ (PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本,我都可以抽出DNA 得意中)MAE{q ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 m"RYP/
好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈BCck_l 希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)yni
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