| |
[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]RwFQ2
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好 
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面d
遇到有台灣深山的時候 通常都會說：iw/
台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種o/$e$
最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型B=1+
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 vL
所以難免會讓人想知道rhCI?
它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)}>
或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異\/
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 P
很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討:9Z*D
但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論>nQ
因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析lQ#$*
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 z&;#
我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係/~pz
用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉r
(用養的要花很久的時間、很多的空間，對我來說比較困難);I?IL
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 1
以下是我有的個體分佈圖^[D)
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 '+Ph
 此主題相關圖片如下：q*
 !F;-*
 '
 按此查看圖片詳細資料M
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 n
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 +$gi
(圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)iE
最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來m
下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山i;cq=^
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 =k>u9
中部藍色為溪頭及杉林溪8
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 '$\:(w
南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園 %.
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ~rE
東部灰色是瑞穗林道@C
(論壇如果不能公布地點，請告訴我，我會把這一段d掉)X+oIK
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 q
一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置B
有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標o6
如果看了不舒服 非常抱歉s
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 |\
一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNA#~kr]
(NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)p`
後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析k=|:
CO1在粒線體的位置如下:G)7RW
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 *c{Di
此主題相關圖片如下：N&
 4Ta`
n0[ejt
按此查看圖片詳細資料Xud9
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 36
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 N#yR
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Wk
我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primerse:EM
Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014;-<
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ]@__
此主題相關圖片如下：c~v2
 M0]EH
_
按此查看圖片詳細資料{Z}/
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 /ywaZ
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 g>SiN6
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 }Xv5
PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning.^SjDS
總共的長度是1302個basepairsZ'K
(因為是universal primer pair，他不是很專一，直接定序不好看。而且[~,
1302個basepairs必須要再設計一組internal primers^K"b
才能得到完整漂亮的序列，乾脆用clone比較方便  )n_e
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 'X`N,
選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群BQO
(期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)."
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 P7yR]U
用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)z5f
然後用Mega跑Parsimony analysis}+H4
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 %ZDD
以下的圖是24個most parsimony tree的consensus treeb/t
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 !N'
此主題相關圖片如下：[PB
 K[
Otkf9X
按此查看圖片詳細資料#\;ucA
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 39
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 fm
(TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山(R
NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道T_)
TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)6,
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 qW^
從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構9$(:"d
已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)$)Vd3
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ;
大概分成中北部、中南部及東部三群lr;
其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣qbAf
然後分成東部的族群 以及中北部的族群"bm,
中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶/G-
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 <j7~
此主題相關圖片如下：1l+
 EBwPN#
D
按此查看圖片詳細資料ZuY'
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 *c*vn
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 W(
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 h4oW8'
以上大概就是初步的結果#B5L3S
畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少t)q
所以你也可以不相信我的結果8
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 fu9h
無論如何F
這是一個值得繼續作下去的題目2Y}2
至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大*d
我可以找到的相關文獻在這g]>-\
http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdfb
台灣深山似乎也有類似allometry的現象b-~X
族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多kDhlo
族群密度地的地方似乎比較少-a'.
而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了I'Z
不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性CA
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 {Kst7
大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點P4X
但是我沒辦法和我的結果連想起來 
相關資料也不多(大多是長度&重量)ZWXGv
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 k%]io
以後還要多收集不同產地的台灣深山Q
以及多去博物館量外部型態特徵0=QrEV
(想要到交易版徵有確切產地的蟲，可是不敢  呵呵)fjn<3H
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 *-
感謝很多送我標本的人)=cHi3
裡面只有溪頭一隻是我自己抓的4>;)y
其他的夢蟲無我老闆提供很多 ,)bm\
嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等NS
非常感謝{
外群是跟zozo買來的乾標本qR,P0
(PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本，我都可以抽出DNA  得意中)q8e
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 r#
好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈(,
希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)L~.
| |
頂端 
加到"我的最愛"
主題管理：
總固頂 
取消總固頂 
短訊息
查看
搜尋
通訊錄
引用
回覆
2006/10/08 03:25:55pm 
IP: 已設定保密
