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[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]@Gf
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面FA& 遇到有台灣深山的時候 通常都會說:)y!a] 台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種@ 最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型\`3Tm ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 [ 所以難免會讓人想知道'nyN 它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)iS 或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異|WZ' ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 /0$= 很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討f 但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論{DaA 因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析M4' ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 kV.-7 我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係e.w 用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉|> (用養的要花很久的時間、很多的空間,對我來說比較困難)102zC_ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 c 以下是我有的個體分佈圖aP ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 x
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按此查看圖片詳細資料06[ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 (. ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 qe- (圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)zC" 最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來r{Y1=} 下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山K$ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 o`sCkL 中部藍色為溪頭及杉林溪;@)` ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 5o4y 南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園~i]W ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 C8fr(d 東部灰色是瑞穗林道:L=r' (論壇如果不能公布地點,請告訴我,我會把這一段d掉)E!w] ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 )rq, 一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置m[ 有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標Q4 如果看了不舒服 非常抱歉8_%RH9 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 .;
一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNATp (NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)$cK3:Z 後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析oA0d CO1在粒線體的位置如下:PR+K ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 >
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按此查看圖片詳細資料@l ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 .fV[YT ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ' ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 %m4Ly 我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primersu9> Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014Q ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Xf#
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按此查看圖片詳細資料!Z ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 W ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 (QlFbO ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Wh26 PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning.J2fpn 總共的長度是1302個basepairs]7jU (因為是universal primer pair,他不是很專一,直接定序不好看。而且F= 1302個basepairs必須要再設計一組internal primersNJ%u 才能得到完整漂亮的序列,乾脆用clone比較方便 )Gh\sUW ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 `< 選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群P (期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)pR]c ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 @ 用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)Me 然後用Mega跑Parsimony analysisjV. ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Z 以下的圖是24個most parsimony tree的consensus tree% ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 +)7
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按此查看圖片詳細資料ViQ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ,Rd- ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 UhA (TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山-kT2w1 NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道?J[ TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)N+e0uc ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 p 從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構M{ 已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)RRhpg ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 0dP 大概分成中北部、中南部及東部三群Y5u 其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣c 然後分成東部的族群 以及中北部的族群Yg 中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶p; ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ^k
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按此查看圖片詳細資料maRagV ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 d3%<9 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 wgE ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ~VX5 以上大概就是初步的結果"eI 畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少V 所以你也可以不相信我的結果FMU"ZH ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 O 無論如何`]BVvM 這是一個值得繼續作下去的題目f 至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大fQ> 我可以找到的相關文獻在這=0?9 http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdf3v 台灣深山似乎也有類似allometry的現象6 族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多JOU5c 族群密度地的地方似乎比較少35' 而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了]7 不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性!AcU0 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 K+ 大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點I49 但是我沒辦法和我的結果連想起來
相關資料也不多(大多是長度&重量)T^ek ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 9XT6 以後還要多收集不同產地的台灣深山FF0& 7 以及多去博物館量外部型態特徵`(N'x (想要到交易版徵有確切產地的蟲,可是不敢 呵呵), ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 U 感謝很多送我標本的人9gJiw 裡面只有溪頭一隻是我自己抓的$ 其他的夢蟲無我老闆提供很多 u8G8 嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等(aF 非常感謝~|)V 外群是跟zozo買來的乾標本3|\.= (PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本,我都可以抽出DNA 得意中)Z ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 mk"yW
好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈`#62W 希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)$=BJ0D
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