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[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]<wqx
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面th6{!? 遇到有台灣深山的時候 通常都會說:)Wt\# 台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種/ 最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型[;UP`W ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 pNIP4P 所以難免會讓人想知道'c&bU 它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)8yKtFl 或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異^E&]8' ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 r 很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討NU'v<e 但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論s-4 因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析A ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 oX 我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係,u%T! 用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉t1nV (用養的要花很久的時間、很多的空間,對我來說比較困難)xqg ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 GN_IX 以下是我有的個體分佈圖_ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 v
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按此查看圖片詳細資料[n4%c ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 vR) ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ?kaA (圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)PD6 最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來:w 下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山Zn ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 K..OJf 中部藍色為溪頭及杉林溪02 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 pb8 南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園T#4` ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 y"Bq 東部灰色是瑞穗林道l (論壇如果不能公布地點,請告訴我,我會把這一段d掉)igBK ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 \Ro 一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置\+| 有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標h 如果看了不舒服 非常抱歉j ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 "oe
一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNA70nG (NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)0.085 後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析a>!c CO1在粒線體的位置如下:[ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 z;b3x`
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按此查看圖片詳細資料fYT ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 +Ch ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ~N$Y_ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 X 我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primers*)B Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014ojd<I ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 5faZ)
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按此查看圖片詳細資料h48J ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 K ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 iv<U ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 xn.y PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning.{NFKd 總共的長度是1302個basepairs6x (因為是universal primer pair,他不是很專一,直接定序不好看。而且UoRT 1302個basepairs必須要再設計一組internal primersK| 才能得到完整漂亮的序列,乾脆用clone比較方便 )gQT ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 f 選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群BN%B (期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)4[#%' ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 m,_ 用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)+I{~U 然後用Mega跑Parsimony analysis,; ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 /{K+ 以下的圖是24個most parsimony tree的consensus tree9XS<5D ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 eU`qF
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按此查看圖片詳細資料8na/ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 O ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 T]qy(> (TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山,wtk\p NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道?DO" TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)- ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 mI9 從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構o'*j/ 已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)`QRS?& ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ME 大概分成中北部、中南部及東部三群\\3 其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣R/]1kT 然後分成東部的族群 以及中北部的族群@3{.! 中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶v ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 =-\$5j
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按此查看圖片詳細資料F8r ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 l=$U* ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 BU"q ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 9m6y{ 以上大概就是初步的結果hlq( 畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少bE{ 所以你也可以不相信我的結果X:;Y ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 {j>)[ 無論如何j8fju 這是一個值得繼續作下去的題目?] 至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大!Xixv8 我可以找到的相關文獻在這F http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdfC' 台灣深山似乎也有類似allometry的現象^L6'<T 族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多!R=cm 族群密度地的地方似乎比較少| 而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了Vu 不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性Bh ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ll 大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點i>5l!W 但是我沒辦法和我的結果連想起來
相關資料也不多(大多是長度&重量)j] v ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ,p1I 以後還要多收集不同產地的台灣深山O 以及多去博物館量外部型態特徵BU,u{o (想要到交易版徵有確切產地的蟲,可是不敢 呵呵)YV ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Y@ 感謝很多送我標本的人ncI 裡面只有溪頭一隻是我自己抓的=-OIJ1 其他的夢蟲無我老闆提供很多 "auJ 嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等30T/ 非常感謝P]{vkG 外群是跟zozo買來的乾標本"` (PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本,我都可以抽出DNA 得意中)r ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 [VU<rV
好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈$R 希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)\s\
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