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 airbugsHuang 

 

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  [這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]@Gf
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好 在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面FA&
遇到有台灣深山的時候  通常都會說:)y!a]
台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種@
最近在論壇上面看到  有人也覺得有東部型\`3Tm
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   [
所以難免會讓人想知道'nyN
它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)iS
或是  這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異|WZ'
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很多的書都寫著  這樣的關係值得深入去探討f
但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論{DaA
因此  最近收到一些標本的我  就先把手頭上有的個體分析M4'
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   kV.-7
我所用的方法  是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係e.w
用這個方法得到資料比較快  而且我也比較熟悉|>
(用養的要花很久的時間、很多的空間,對我來說比較困難)102zC_
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以下是我有的個體分佈圖aP
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(圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)zC"
最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來r{Y1=}
下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山K$
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   o`sCkL
中部藍色為溪頭及杉林溪;@)`
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南部綠色為阿里山  及東部的利佳林道和南橫栗園~i]W
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東部灰色是瑞穗林道:L=r'
(論壇如果不能公布地點,請告訴我,我會把這一段d掉)E!w]
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   )rq,
一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置m[
有一點與現今台灣政治顏色相同  所以這樣標Q4
如果看了不舒服  非常抱歉8_%RH9
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一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNATp
(NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)$cK3:Z
後來知道現在bar coding是用CO1  所以我就用CO1來分析oA0d
CO1在粒線體的位置如下:PR+K
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我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primersu9>
Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014Q
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PCR之後 切膠純化  然後作TA cloning.J2fpn
總共的長度是1302個basepairs]7jU
(因為是universal primer pair,他不是很專一,直接定序不好看。而且F=
1302個basepairs必須要再設計一組internal primersNJ%u
才能得到完整漂亮的序列,乾脆用clone比較方便 )Gh\sUW
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選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群P
(期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像  也許是姊妹群)pR]c
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用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)Me
然後用Mega跑Parsimony analysisjV.
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以下的圖是24個most parsimony tree的consensus tree%
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(TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山-kT2w1
NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道?J[
TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)N+e0uc
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從CO1的結果來看  台灣深山的各族群遺傳結構M{
已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)RRhpg
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   0dP
大概分成中北部、中南部及東部三群Y5u
其中看的出來方向性  嘉義阿里山最先進來台灣c
然後分成東部的族群  以及中北部的族群Yg
中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶p;
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以上大概就是初步的結果"eI
畢竟我每個地方的個體不多  而且點也很少V
所以你也可以不相信我的結果FMU"ZH
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   O
無論如何`]BVvM
這是一個值得繼續作下去的題目f
至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大fQ>
我可以找到的相關文獻在這=0?9
http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdf3v
台灣深山似乎也有類似allometry的現象6
族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多JOU5c
族群密度地的地方似乎比較少35'
而這樣的結果在目前的分析看來  似乎有遺傳的差異純在了]7
不過還是一句  我的sample size很小  他依舊可能是型態的可塑性!AcU0
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   K+
大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點I49
但是我沒辦法和我的結果連想起來 相關資料也不多(大多是長度&重量)T^ek
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   9XT6
以後還要多收集不同產地的台灣深山FF0& 7
以及多去博物館量外部型態特徵`(N'x
(想要到交易版徵有確切產地的蟲,可是不敢 呵呵),
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   U
感謝很多送我標本的人9gJiw
裡面只有溪頭一隻是我自己抓的$
其他的夢蟲無我老闆提供很多  u8G8
嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等(aF
非常感謝~|)V
外群是跟zozo買來的乾標本3|\.=
(PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本,我都可以抽出DNA  得意中)Z
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇   mk"yW
好了  在論壇潛水很久  好像做了一點事  哈哈`#62W
希望畢業前這個alternative作的完  "或是有人接"(變向的招收學生)$=BJ0D



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發表文章時間2006/10/08 03:25:55pm IP: 已設定保密[本文共 4042 位元組]  

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 主文章: 這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好 在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面遇到有台灣深山的時候 &# ...   作者:airbugsHuang 2006/10/08 
  回覆: 好文值得大力推請問是否有鍬形蟲體型相關基因被cloned 或identifiedmt CO1 和體型的相關性???/量 ...   作者:kefarm 2006/10/16 
  回覆: 鍬形蟲體型相關基因應該是還沒被cloned 或identified樓主用的基因應該是粒線體DNA吧是一段較不會 ...   作者:thegame0930 2006/10/16 
  回覆: 粒線體DNA和應該體形基因無關我只是想說拿鍬形虫當材料比果蠅辛苦多多也許昆蟲體形基因在果蠅研 ...   作者:kefarm 2006/10/17 
  回覆: 粒線體DNA與體型應該是沒有關係的畢竟它不是核DNA它在細胞裡面是用來產生能量基本上會選這一段來 ...   作者:airbugsHuang 2006/10/17 
  回覆: 對於這種用心探討的態度及勇氣相當佩服勒相信要做這些出來 您應該花了不少心力成果也是有目共睹 ...   作者:formosanus 2006/10/19 
  回覆: Maximum parsimony tree共有24條我放的這一棵tree是這24條的consensus tree那  我沒有放dis ...   作者:airbugsHuang 2006/10/21 
  回覆: 就學術的角度來看是相當不錯所得到的結果可否能有實務上的應用不是說學術領域的探討不重要畢竟現 ...   作者:chengtw 2006/11/21 
  回覆: 務實的應用可能比較難,因為我當時想的都是對氣候變遷,或是環境及地理變化對對生物遺傳結構的影 ...   作者:airbugsHuang 2010/12/20 
  回覆: 這一個研究今年終於刊登出來了!一直都因為研究裡面有的個體太少,所以寫討論和結果比較難。不過 ...   作者:airbugsHuang 2010/12/20 

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