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[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]l]gzva
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好 
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面<Bi
遇到有台灣深山的時候 通常都會說："[
台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種f
最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型KX(.
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所以難免會讓人想知道ZY;
它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)}c|
或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異RV0g
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很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討R
但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論2Eih
因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析Cm|jw
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我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係3
用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉%FI{(-
(用養的要花很久的時間、很多的空間，對我來說比較困難)PAG)b
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以下是我有的個體分佈圖Ph@N
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(圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)(
最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來ZrB48m
下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山V)~/W
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中部藍色為溪頭及杉林溪H)t
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南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園%
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東部灰色是瑞穗林道]28sar
(論壇如果不能公布地點，請告訴我，我會把這一段d掉)r%
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一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置#
有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標~"d:rA
如果看了不舒服 非常抱歉)g
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一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNAj'zl
(NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)H9
後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析d=5
CO1在粒線體的位置如下:A5=
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我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primersTSq`
Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014d5EF
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PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning.&/*{^
總共的長度是1302個basepairs(ze
(因為是universal primer pair，他不是很專一，直接定序不好看。而且=CO
1302個basepairs必須要再設計一組internal primers{q
才能得到完整漂亮的序列，乾脆用clone比較方便  )@
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選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群&`y!'p
(期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)+O
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用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)Mwq
然後用Mega跑Parsimony analysissW
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以下的圖是24個most parsimony tree的consensus treeQAyX
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(TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山QnMT&
NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道J@
TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)W2nY
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從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構Jfp+G
已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)'?JN>
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大概分成中北部、中南部及東部三群oT#M-
其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣8P_FEy
然後分成東部的族群 以及中北部的族群u
中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶/
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以上大概就是初步的結果)9/
畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少3ICs
所以你也可以不相信我的結果imi'U:
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無論如何tN
這是一個值得繼續作下去的題目g
至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大;T
我可以找到的相關文獻在這7)H
http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdfF
台灣深山似乎也有類似allometry的現象.=G3
族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多b#7x|x
族群密度地的地方似乎比較少Q
而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了N
不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性q'ryY9
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 vT`dfc
大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點+S
但是我沒辦法和我的結果連想起來 
相關資料也不多(大多是長度&重量)r!Q7
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以後還要多收集不同產地的台灣深山0;{
以及多去博物館量外部型態特徵]
(想要到交易版徵有確切產地的蟲，可是不敢  呵呵)D
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 B{
感謝很多送我標本的人e`
裡面只有溪頭一隻是我自己抓的4)
其他的夢蟲無我老闆提供很多 xpt
嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等l%!w!
非常感謝hgt
外群是跟zozo買來的乾標本r8F
(PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本，我都可以抽出DNA  得意中)<9
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好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈#~
希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)gH{
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2006/10/08 03:25:55pm 
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