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[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]Z"9}_Z
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好 
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面P6C%
遇到有台灣深山的時候 通常都會說：]
台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種Wg
最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型},1
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所以難免會讓人想知道mI8|i
它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本):4
或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異y2c+
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很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討J
但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論+L
因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析T?
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我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係4oW
用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉/yp]X=
(用養的要花很久的時間、很多的空間，對我來說比較困難)+Y*)uI
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以下是我有的個體分佈圖9
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 此主題相關圖片如下：g,8bhJ
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(圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)S
最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來+'VP|
下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山o
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中部藍色為溪頭及杉林溪Y0
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南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園v`H
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東部灰色是瑞穗林道U^Hmm
(論壇如果不能公布地點，請告訴我，我會把這一段d掉)|
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一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置9w=bt_
有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標;T
如果看了不舒服 非常抱歉B
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一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNA}/
(NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)^O+02>
後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析R
CO1在粒線體的位置如下:n 7
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我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primersKRH
Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014J>.sR8
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PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning.=L
總共的長度是1302個basepairsd
(因為是universal primer pair，他不是很專一，直接定序不好看。而且G4p
1302個basepairs必須要再設計一組internal primersXTR
才能得到完整漂亮的序列，乾脆用clone比較方便  )$-
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選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群h
(期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)Pvp
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用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)l:
然後用Mega跑Parsimony analysisSOt*;
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以下的圖是24個most parsimony tree的consensus treek*TiK
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(TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山2F
NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道(;
TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)f\x"
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從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構Cb
已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)=*
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大概分成中北部、中南部及東部三群FB (R,
其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣}7PQ&n
然後分成東部的族群 以及中北部的族群ojnl=
中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶C
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以上大概就是初步的結果eR-P}
畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少Wf/
所以你也可以不相信我的結果GNd.1
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無論如何&\u
這是一個值得繼續作下去的題目d
至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大B
我可以找到的相關文獻在這$B f>
http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdfForh
台灣深山似乎也有類似allometry的現象;727sR
族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多LLJu9I
族群密度地的地方似乎比較少O<
而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了q-ND0a
不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性_Ne
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大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點UQj<~@
但是我沒辦法和我的結果連想起來 
相關資料也不多(大多是長度&重量)Z=(@
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以後還要多收集不同產地的台灣深山l8{
以及多去博物館量外部型態特徵a{i'=
(想要到交易版徵有確切產地的蟲，可是不敢  呵呵)d{Mfj^
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感謝很多送我標本的人#i
裡面只有溪頭一隻是我自己抓的\A7a
其他的夢蟲無我老闆提供很多 }")X
嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等;>b
非常感謝x9<
外群是跟zozo買來的乾標本=~B
(PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本，我都可以抽出DNA  得意中)]ST
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好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈QHE;
希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)1h
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