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主題標題： [分享] 測試分子條碼在歐洲深山種群的適用性

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文章一覽：[分享] 測試分子條碼在歐洲深山種群的適用性 (新回覆在最前面,最多列出 6 個)　 [列出所有回覆]

papilio 發表於： 2014/01/07 01:57:39am

下面引用由airbugsHuang在 2014/01/05 04:45:05pm 發表的內容：
1. 土耳其的同一棵樹上可以發現Lcj，Lca，及Lcl。但是這三種之間的分子差異極大，完全是不一樣的類群。
這裡我是說長在森林裡面的那一種樹。目的是要說這三種歐洲深山共域！
分子差異是根據附圖及文章裡面整理的 ...

這一期ZooKeys基本上是Barcoding專輯
都來看看好了~

papilio 發表於： 2014/01/07 01:53:18am

[這篇文章最後由papilio在 2014/01/07 02:03:37am 第 2 次編輯]

下面引用由lacosteman在 2014/01/06 10:40:15pm 發表的內容：
蛤？
看不懂...
真的樹(true tree)永遠無法被找到，這是基本④␀敢z想幫我說什麼...)
不過，還是謝謝指教了！

真正的那棵演化樹無法被找到...
我沒有想要幫你回答什麼，因為我壓根看不懂你在說什麼。
所以我只是嘗試想要知道你的問題在哪裡。
另外請問真的樹跟分類樹差在哪裡？

lacosteman 發表於： 2014/01/06 10:40:15pm

下面引用由papilio在 2014/01/06 01:08:16am 發表的內容：
蛤？
看不懂...
真的樹(true tree)永遠無法被找到，這是基本觀念。
分類樹又是什麼東西？
...

蛤？
看不懂...
真的樹(true tree)永遠無法被找到，這是基本觀念。(對！大大您說的沒錯！！！不過您曲解我的意思了！真的樹如果永遠無法被找到，那馬路上那些是啥??很高的草嗎=,=，其實我也不懂您想幫我說什麼...)
不過，還是謝謝指教了！

papilio 發表於： 2014/01/06 09:53:31pm

你不會覺得這話題太難哦...

airbugsHuang 發表於： 2014/01/06 04:45:05am

[這篇文章最後由airbugsHuang在 2014/01/05 05:01:41pm 第 2 次編輯]

1. 土耳其的同一棵樹上可以發現Lcj，Lca，及Lcl。但是這三種之間的分子差異極大，完全是不一樣的類群。

這裡我是說長在森林裡面的那一種樹。目的是要說這三種歐洲深山共域！
分子差異是根據附圖及文章裡面整理的分子片段差異。目的是要說這三種之間有基因交流的機會不大。
是兩個不一樣的事情，所以應該是我寫得不夠清楚...
本來這一篇文章有想要討論把Lcj，Lca，Lcl提升為不同“種”。
但是就像Papilio大大說的只有單一分子證據，
所以這一篇文章就把那一部分去掉了（可以寫信去問Karen或Anno）。

就像他們文章裡面說的，這是一個開始的計劃，
我們知道有很多的歐洲深山，每一個種（亞種，型，或族群）之間其實很難找到差異在哪裡。
以前用形態證據很難，現在再告訴你用分子鑑定也很難。
但是這些並不是系統分類學門的全部，還有很多族群遺傳學的模型可以用來解決這些問題，這一些也會是歐洲深山研究團隊後的方向。
至於選用的分子片段會有不一樣的tree topologies跟demographic history比較有關係。有沒有分在同一群或是分不出差異都只是單一gene tree的topology。這些研究員也都知道這一點，所以之後他們會試更多的分子資料並用其他的方法來討論這一個有趣的現象！（不會有人期待用一個基因就解決近期分化的族群/種之間的關係）。
他們是在討論裡面講了我提的那些有趣的點，也是之後研究方向可以測試的假說。

但是！這文章還蠻有用的因為這方法可以告訴你你抓的是Lcc不是Lcj/Lca...如果之後Lca或Lcj變保育紅皮書裡面的生物，保育警察就算你偷渡的是蟲卵，幼蟲，或母蟲都可以有高很快的效率可以鑑定出來！就算你騙保預警察你抓的是Lcc他也可以快速發現你在說謊。
我相信這才是這一篇生物條碼應用的文章目前最大的貢獻。

papilio 發表於： 2014/01/06 01:08:16am

下面引用由lacosteman在 2014/01/06 00:45:13am 發表的內容：
現代分子生物技術用來鑑定非常方便且快速
但分子生物技術若要用在分類上
只能當作一種佐證數據
不能直接拿來做分類依據
...

蛤？
看不懂...
真的樹(true tree)永遠無法被找到，這是基本觀念。
分類樹又是什麼東西？
你說你曾經試驗過，你是做哪種試驗？
用形態還是分子特徵重建親緣關係樹？
用分子的話有沒有想過是因為用錯DNA片段？